Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms