Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlgn1Q99K10 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms