Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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