Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms