Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan1Q99J59 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms