Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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