Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf144aQ925F3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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