Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbox1Q924Y0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms