Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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