Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms