Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms