Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms