Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd3Q91W18 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms