Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms