Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms