Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms