Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms