Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam20bQ8VCS3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam20bQ8VCS3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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