Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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