Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms