Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms