Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms