Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms