Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Trappc12Q8K2L8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Trappc12Q8K2L8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Trappc12Q8K2L8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Trappc12Q8K2L8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Trappc12Q8K2L8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Trappc12Q8K2L8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Trappc12Q8K2L8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Trappc12Q8K2L8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc12Q8K2L8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms