Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp1Q8K021 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms