Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFH6

Sik2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik2Q8CFH6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sik2Q8CFH6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sik2Q8CFH6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms