Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms