Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms