Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc178Q8CDV0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc178Q8CDV0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc178Q8CDV0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc178Q8CDV0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms