Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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