Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nhlrc3Q8CCH2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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