Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd4aQ8CBY1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms