Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms