Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc186Q8C9S4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms