Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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BC106179Q8C9L1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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BC106179Q8C9L1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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BC106179Q8C9L1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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BC106179Q8C9L1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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BC106179Q8C9L1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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BC106179Q8C9L1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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BC106179Q8C9L1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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BC106179Q8C9L1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC106179Q8C9L1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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