Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp20Q8C6M1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp20Q8C6M1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp20Q8C6M1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp20Q8C6M1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms