Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot2Q8C5L3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot2Q8C5L3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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