Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SowahcQ8C0J6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SowahcQ8C0J6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms