Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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