Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn17Q8BXA6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn17Q8BXA6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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