Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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