Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pak4Q8BTW9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pak4Q8BTW9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms