Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep55Q8BT07 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms