Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6kb1Q8BSK8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6kb1Q8BSK8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms