Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ30

Ppp1r18, Phostensin, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r18Q8BQ30 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppp1r18Q8BQ30 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms