Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms