Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms