Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c2Q8BL74 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms