Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp2bQ8BJF9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2bQ8BJF9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms