Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox2Q8BII1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prox2Q8BII1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms